More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2951 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 575 aa  1142    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9272  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  43.65 
 
 		 647 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 430 aa  110  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 516 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  0.503326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.62 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 571 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 490 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  26.81 
 
 		 556 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  26.89 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 491 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.92 
 
 		 547 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 575 aa  94  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 491 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 491 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 541 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.85 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 520 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 517 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 517 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  28.24 
 
 		 6768 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 502 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 525 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 499 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8226  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 381 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  26.22 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  25.55 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  25.96 
 
 		 548 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 515 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  26.77 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  26.34 
 
 		 543 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 515 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  26.15 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.09 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.36 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.18 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  26.13 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.56 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.95 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1841  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 561 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.415178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  26.23 
 
 		 544 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 526 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 520 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 1043 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 518 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 		 557 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  25.62 
 
 		 811 aa  87.4  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 383 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 558 aa  87  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.2 
 
 		 555 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4859  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  26.79 
 
 		 565 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1255  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.5 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.45 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 564 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.74 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  22.93 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  26.57 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  28.1 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  26.29 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.75 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.12 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.11 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.04 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.51 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.5 
 
 		 527 aa  83.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>