More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2248 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 
513 aa  1003    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  51.33 
 
 
528 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  52.11 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 
561 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  44.86 
 
 
690 aa  332  8e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.92 
 
 
481 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.51 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.47 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.51 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.31 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.31 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.03 
 
 
482 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.31 
 
 
481 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.47 
 
 
500 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.9 
 
 
482 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.36 
 
 
481 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.85 
 
 
491 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.15 
 
 
481 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.8 
 
 
492 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.17 
 
 
481 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.15 
 
 
510 aa  253  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.56 
 
 
490 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.08 
 
 
494 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.14 
 
 
473 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.8 
 
 
484 aa  233  5e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.52 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  45.24 
 
 
490 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.43 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.59 
 
 
524 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.43 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
525 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.83 
 
 
492 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
548 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 
519 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.17 
 
 
479 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.83 
 
 
492 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
548 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
535 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
505 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  34.79 
 
 
548 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  29.98 
 
 
503 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
534 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 
514 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.59 
 
 
503 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
499 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
507 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
530 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
523 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
527 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
430 aa  203  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.96 
 
 
453 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  34.07 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  34.26 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  34.07 
 
 
544 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
530 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  27.44 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
532 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
528 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 
662 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  34.14 
 
 
535 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.91 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
498 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
512 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
504 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
508 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
521 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.7 
 
 
525 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.6 
 
 
518 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 
518 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
508 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.31 
 
 
518 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
527 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.8 
 
 
512 aa  193  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 
512 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
520 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.11 
 
 
525 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.31 
 
 
518 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
513 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
539 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
512 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
521 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
495 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
508 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3872  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0626194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.33 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.33 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.33 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>