More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2924 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 491 aa  981    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  99.8 
 
 		 491 aa  980    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  99.8 
 
 		 491 aa  980    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 505 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.01 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 525 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 519 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 515 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 515 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.21 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.7 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.54 
 
 		 525 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 525 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 511 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 578 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.65 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 535 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 502 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.2 
 
 		 486 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 		 519 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.95 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.96 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  33.73 
 
 		 528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 525 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  32.38 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 510 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 531 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 521 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  31.3 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.07 
 
 		 565 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 1043 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.19 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  32.21 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  28.54 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  28.54 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.2 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.85 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.85 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>