More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3902 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  79.02 
 
 
502 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  76.57 
 
 
497 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  79.84 
 
 
502 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  99.8 
 
 
504 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
504 aa  993    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
504 aa  993    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.55 
 
 
525 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 
525 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.12 
 
 
525 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.99 
 
 
530 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.7 
 
 
526 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 
526 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
523 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.19 
 
 
519 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 
527 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 
526 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
520 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
512 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 
504 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
578 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
518 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
505 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.21 
 
 
482 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
522 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
519 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
531 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 
496 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.27 
 
 
515 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 
525 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.14 
 
 
516 aa  206  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
499 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.69 
 
 
490 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
530 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
520 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 
519 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.8 
 
 
481 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.01 
 
 
482 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
509 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 
496 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 
496 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
535 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  27.87 
 
 
496 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 
526 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
520 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
491 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
491 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
491 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
541 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.8 
 
 
482 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.71 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.42 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
521 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.18 
 
 
508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.57 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.75 
 
 
579 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.62 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.62 
 
 
481 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
508 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.39 
 
 
481 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.12 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 
570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  37.04 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.21 
 
 
510 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
507 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
508 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
511 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
508 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
521 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
502 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  30.75 
 
 
522 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
521 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.24 
 
 
565 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
489 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
518 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
515 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
520 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
553 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
523 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 
517 aa  193  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
523 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
561 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
508 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3955  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  29.98 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>