More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2100 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 516 aa  1048    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  0.503326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.933097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 540 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.76 
 
 		 519 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 526 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 520 aa  186  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 525 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 518 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 517 aa  180  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.4 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 512 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 528 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.04 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.179395  normal  0.194105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  26.04 
 
 		 499 aa  170  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 493 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 511 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  26.53 
 
 		 500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  28.13 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 527 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 506 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  26.7 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  26.33 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  28.24 
 
 		 529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  28.43 
 
 		 536 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  26.92 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  26.92 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 536 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  26.61 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.71 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  28.21 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 517 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  26.9 
 
 		 488 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 529 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 		 536 aa  163  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.52 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  26.81 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 569 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 5154 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  26.25 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 2376 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  27.46 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  27.79 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.18 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 		 554 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 662 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 584 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 584 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.02 
 
 		 491 aa  158  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  28.99 
 
 		 6768 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 545 aa  157  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>