More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0445 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
562 aa  1141    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  61.47 
 
 
576 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 
555 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  52.58 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  53.57 
 
 
538 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 
539 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 
541 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 
544 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  52.28 
 
 
555 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  52.97 
 
 
539 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  52.81 
 
 
539 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  52.23 
 
 
539 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 
539 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 
539 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  48.82 
 
 
551 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 
535 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  51.29 
 
 
553 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  51.87 
 
 
539 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  50.94 
 
 
535 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 
547 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 
557 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  51.19 
 
 
556 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 
535 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  51.14 
 
 
532 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  51.69 
 
 
539 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  49.72 
 
 
513 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  48.34 
 
 
543 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 
543 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  50.66 
 
 
562 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 
562 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  43.92 
 
 
576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  49.33 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
595 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 
558 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 
571 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
603 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
552 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  43.22 
 
 
562 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  43.58 
 
 
541 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
552 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 
522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 
560 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 
537 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
525 aa  336  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  34.5 
 
 
571 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.1 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  38.98 
 
 
585 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.95 
 
 
571 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  36.16 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  36.16 
 
 
572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
548 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  37.73 
 
 
588 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  37.73 
 
 
588 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  38.29 
 
 
602 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
530 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  37.81 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
609 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
554 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  37.1 
 
 
584 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
592 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  37.85 
 
 
555 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 
566 aa  296  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
553 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
548 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  36.48 
 
 
607 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  37.76 
 
 
555 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 
554 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
616 aa  293  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 
547 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
567 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 
555 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
551 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  33.64 
 
 
586 aa  291  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  37.89 
 
 
598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 
569 aa  289  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  34.95 
 
 
563 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  38.27 
 
 
588 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 
555 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
498 aa  287  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  34.3 
 
 
584 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
557 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>