More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5720 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
490 aa  974    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.25 
 
 
481 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.87 
 
 
500 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.24 
 
 
513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.87 
 
 
482 aa  226  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.56 
 
 
482 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.56 
 
 
482 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 
482 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.37 
 
 
491 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.1 
 
 
482 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.18 
 
 
482 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.1 
 
 
481 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.18 
 
 
481 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.18 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.76 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.46 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.05 
 
 
498 aa  213  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.8 
 
 
479 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.83 
 
 
528 aa  210  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  43.66 
 
 
494 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.25 
 
 
490 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.16 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.85 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
561 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 
430 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.64 
 
 
473 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.23 
 
 
492 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.23 
 
 
492 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.44 
 
 
510 aa  193  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.97 
 
 
491 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.01 
 
 
475 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.63 
 
 
484 aa  186  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.1 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.43 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  30.53 
 
 
464 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.83 
 
 
470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.55 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.83 
 
 
475 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.05 
 
 
478 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.53 
 
 
451 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
382 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.24 
 
 
504 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.8 
 
 
477 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  39.69 
 
 
391 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 
381 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 
503 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  45.39 
 
 
489 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
502 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.78 
 
 
477 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
515 aa  170  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
507 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.69 
 
 
472 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.91 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.36 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  30.23 
 
 
504 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 
505 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.21 
 
 
482 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 
444 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 
530 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
498 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.47 
 
 
503 aa  160  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.7 
 
 
459 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  31.67 
 
 
519 aa  160  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.89 
 
 
501 aa  160  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
487 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.19 
 
 
504 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
690 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.23 
 
 
477 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
515 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
523 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
526 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.6 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.08 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.16 
 
 
354 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  31.39 
 
 
519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.44 
 
 
394 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.1 
 
 
345 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
499 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 
333 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  30.97 
 
 
529 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.54 
 
 
461 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 
507 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
485 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 
594 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.86 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 
534 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.97 
 
 
495 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.21 
 
 
354 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 
513 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
519 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.21 
 
 
354 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>