More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0307 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  71.24 
 
 		 464 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  76.7 
 
 		 478 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  68.71 
 
 		 491 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  68.99 
 
 		 491 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  69.72 
 
 		 487 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  75.76 
 
 		 475 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 		 472 aa  976    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  76.42 
 
 		 475 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  76.59 
 
 		 470 aa  726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  54.6 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  56.25 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  53.24 
 
 		 504 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  50.63 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.81 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  49.05 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.13 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.75 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.11 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.41 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.91 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.19 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.11 
 
 		 455 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.11 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.57 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.46 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.39 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.96 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.68 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.19 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.74 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.74 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.9 
 
 		 482 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.19 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.62 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.2 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.2 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  33.11 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.11 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  33.11 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.85 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.12 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.58 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.05 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.42 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 482 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.76 
 
 		 481 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.48 
 
 		 482 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.31 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.5 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.37 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.75 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.99 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.74 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.69 
 
 		 524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.59 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.83 
 
 		 518 aa  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.57 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.78 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.9 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.45 
 
 		 518 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 843 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 520 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  26.18 
 
 		 574 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 518 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 518 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.9 
 
 		 518 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 562 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.24 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.38 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.38 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 		 542 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>