More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1131 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 		 459 aa  919    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.97 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.23 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.53 
 
 		 462 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.81 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.72 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.36 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 455 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.13 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.06 
 
 		 477 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.13 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.85 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.97 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.04 
 
 		 475 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.66 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.14 
 
 		 487 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.98 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.29 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  37.73 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.73 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.88 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  37.73 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.12 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.57 
 
 		 472 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.12 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  35.21 
 
 		 464 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.3 
 
 		 480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.41 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.54 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.69 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.78 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.18 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.69 
 
 		 471 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.48 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.09 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.17 
 
 		 470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.31 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.43 
 
 		 453 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.08 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.09 
 
 		 475 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.92 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.14 
 
 		 504 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.58 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.3 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.76 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.96 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.75 
 
 		 483 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.71 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.25 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.79 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.69 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.23 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.76 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 490 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.15 
 
 		 482 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 482 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.81 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.34 
 
 		 500 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.53 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.53 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.46 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.71 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.58 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.88 
 
 		 513 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.71 
 
 		 484 aa  149  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.25 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.88 
 
 		 528 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 561 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 448 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.2 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 526 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.45 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.45 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 690 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 503 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.06 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.19 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.45 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 5154 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  25.58 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>