More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1497 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
690 aa  1340    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  49.69 
 
 
528 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 
561 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.03 
 
 
498 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.09 
 
 
513 aa  330  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.39 
 
 
486 aa  265  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.3 
 
 
500 aa  256  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.61 
 
 
482 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.81 
 
 
482 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.81 
 
 
482 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.22 
 
 
482 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.11 
 
 
481 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.61 
 
 
482 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.61 
 
 
481 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.61 
 
 
482 aa  248  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.97 
 
 
481 aa  247  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.99 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.7 
 
 
490 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.4 
 
 
492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.34 
 
 
510 aa  233  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.22 
 
 
491 aa  230  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.02 
 
 
494 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
508 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
508 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
489 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.74 
 
 
473 aa  200  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
508 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.75 
 
 
474 aa  191  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.66 
 
 
492 aa  191  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.15 
 
 
484 aa  191  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.66 
 
 
492 aa  191  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 
499 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.79 
 
 
513 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.84 
 
 
514 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 
525 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  27.87 
 
 
515 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.56 
 
 
503 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
531 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.75 
 
 
479 aa  177  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.8 
 
 
453 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.91 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.31 
 
 
514 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
501 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  30.02 
 
 
516 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.52 
 
 
477 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
527 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  27.16 
 
 
496 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  27.16 
 
 
496 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
505 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  27.16 
 
 
496 aa  171  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  25.86 
 
 
496 aa  170  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 
518 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  27.62 
 
 
500 aa  170  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
513 aa  170  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.62 
 
 
500 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.94 
 
 
518 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
530 aa  168  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
519 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
513 aa  167  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  27.27 
 
 
499 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
518 aa  167  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  28.79 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  27.41 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 
569 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
430 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.8 
 
 
519 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.56 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  27.1 
 
 
500 aa  164  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  27.1 
 
 
500 aa  164  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 
512 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  27.2 
 
 
500 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
519 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  29.94 
 
 
503 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  27.9 
 
 
564 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 
518 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
500 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
520 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
507 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 
518 aa  162  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.73 
 
 
518 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 
532 aa  162  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.77 
 
 
518 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 
518 aa  161  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 
518 aa  161  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
514 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 
522 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
531 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
544 aa  160  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
533 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 
518 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.52 
 
 
517 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  28 
 
 
560 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.52 
 
 
517 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.52 
 
 
517 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>