More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2796 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
492 aa  1026    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  72.69 
 
 
490 aa  744    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.76 
 
 
481 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.82 
 
 
482 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.17 
 
 
481 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.2 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.2 
 
 
482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.34 
 
 
481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.99 
 
 
482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.58 
 
 
482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.93 
 
 
481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.79 
 
 
482 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.9 
 
 
481 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  47.25 
 
 
486 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.48 
 
 
500 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.13 
 
 
510 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.44 
 
 
473 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.48 
 
 
479 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.21 
 
 
484 aa  362  6e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 
509 aa  315  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 
496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
496 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  35.19 
 
 
496 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
496 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34 
 
 
503 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
508 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  36.78 
 
 
516 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
508 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.42 
 
 
529 aa  289  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.86 
 
 
498 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
501 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.97 
 
 
491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.91 
 
 
451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  35.31 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.12 
 
 
494 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.11 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.11 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.11 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
518 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
505 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 
524 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.18 
 
 
474 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.05 
 
 
504 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.87 
 
 
492 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.87 
 
 
492 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
525 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
517 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
1043 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.17 
 
 
528 aa  263  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.42 
 
 
453 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
554 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 
519 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
521 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
512 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
551 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
514 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.8 
 
 
513 aa  260  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
620 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 
514 aa  259  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
513 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
507 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  33.91 
 
 
500 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
502 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
501 aa  253  8.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7038  hypothetical protein  32.19 
 
 
544 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
503 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
502 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
524 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
518 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 
512 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
515 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
512 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
526 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 
519 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
546 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
530 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
489 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
520 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.07 
 
 
508 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
534 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
518 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
520 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.55 
 
 
518 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
520 aa  243  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
506 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 
518 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
534 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 
518 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
500 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 
518 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
506 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>