More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2405 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
382 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  59.47 
 
 
391 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  62.09 
 
 
381 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  57.51 
 
 
444 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  61.11 
 
 
391 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.81 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  47.07 
 
 
386 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  48.87 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  45.41 
 
 
434 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.95 
 
 
345 aa  222  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 
381 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  46.91 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.71 
 
 
354 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  45.65 
 
 
372 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.55 
 
 
354 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.55 
 
 
354 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 
396 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  46.28 
 
 
394 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.23 
 
 
361 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.9 
 
 
394 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 
366 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.7 
 
 
513 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  44.11 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.52 
 
 
384 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 
428 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.2 
 
 
498 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
561 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37 
 
 
528 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  43.99 
 
 
393 aa  175  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  39.94 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
490 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  48.58 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.09 
 
 
510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.94 
 
 
494 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.31 
 
 
500 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.6 
 
 
461 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
489 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.53 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.53 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.53 
 
 
482 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.8 
 
 
435 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.23 
 
 
482 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.23 
 
 
482 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.83 
 
 
481 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.95 
 
 
491 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.01 
 
 
459 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.63 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.64 
 
 
465 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.34 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.65 
 
 
481 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.45 
 
 
476 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.68 
 
 
473 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.34 
 
 
482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.65 
 
 
482 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.57 
 
 
486 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.18 
 
 
492 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 
505 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1628  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
395 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.87 
 
 
481 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.92 
 
 
451 aa  143  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.29 
 
 
463 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.92 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
955 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.98 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0588  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 
515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.87 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
546 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.94 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.75 
 
 
470 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.81 
 
 
479 aa  139  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.01 
 
 
453 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.43 
 
 
489 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
495 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 
526 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.42 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  33.5 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
531 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.52 
 
 
482 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.31 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.15 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.15 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.86 
 
 
475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.18 
 
 
474 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.84 
 
 
490 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31 
 
 
484 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 
495 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
506 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.97 
 
 
451 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.88 
 
 
492 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.88 
 
 
492 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
520 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
520 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.48 
 
 
451 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>