More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2649 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  78.84 
 
 
451 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  78.84 
 
 
451 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  78.17 
 
 
451 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  99.12 
 
 
455 aa  916    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  78.4 
 
 
451 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  78.84 
 
 
451 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  79.06 
 
 
451 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  72.38 
 
 
453 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  98.46 
 
 
455 aa  907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  79.29 
 
 
451 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  79.29 
 
 
451 aa  701    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  98.24 
 
 
455 aa  907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  79.29 
 
 
451 aa  703    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  98.68 
 
 
455 aa  911    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
455 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.92 
 
 
462 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  58.37 
 
 
461 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.99 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.89 
 
 
461 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.91 
 
 
487 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.24 
 
 
471 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.57 
 
 
471 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.02 
 
 
471 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.93 
 
 
465 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.23 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.05 
 
 
483 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.05 
 
 
476 aa  329  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.35 
 
 
475 aa  316  7e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.6 
 
 
487 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.03 
 
 
491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.73 
 
 
484 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.81 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.13 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.19 
 
 
472 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.74 
 
 
475 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.26 
 
 
515 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.81 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.03 
 
 
475 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  32.81 
 
 
464 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.03 
 
 
478 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.15 
 
 
480 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.2 
 
 
504 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.03 
 
 
504 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.81 
 
 
482 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.18 
 
 
504 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.89 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.94 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.92 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.02 
 
 
465 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.19 
 
 
489 aa  216  9e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.55 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.8 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.74 
 
 
477 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.4 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.57 
 
 
453 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.68 
 
 
473 aa  149  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.43 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
481 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
482 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
482 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.29 
 
 
484 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.78 
 
 
482 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.78 
 
 
481 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.2 
 
 
479 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
482 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.78 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
507 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
542 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 
492 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.08 
 
 
500 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.36 
 
 
481 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.27 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
502 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.09 
 
 
490 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.47 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
430 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.92 
 
 
486 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2952  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.2 
 
 
492 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.77 
 
 
491 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.49 
 
 
474 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 
520 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
525 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.74 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  24.38 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.02 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.25 
 
 
513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  25.83 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  27.22 
 
 
500 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.56 
 
 
463 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.41 
 
 
501 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
381 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 
553 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>