More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
501 aa  1016    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  41.91 
 
 
955 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  48.54 
 
 
1027 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.22 
 
 
474 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.67 
 
 
500 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.19 
 
 
482 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.7 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.71 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.36 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.86 
 
 
486 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.09 
 
 
492 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 
482 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.09 
 
 
492 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 
481 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.42 
 
 
482 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.96 
 
 
473 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.21 
 
 
481 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.06 
 
 
482 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.1 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.97 
 
 
492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.15 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.83 
 
 
453 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.24 
 
 
498 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.75 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31 
 
 
479 aa  163  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.26 
 
 
528 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
430 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.81 
 
 
481 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
520 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.69 
 
 
491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.92 
 
 
529 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.2 
 
 
510 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
490 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.67 
 
 
494 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
561 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
381 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
508 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  31.28 
 
 
532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.43 
 
 
477 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
515 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
508 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  29.1 
 
 
569 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.86 
 
 
482 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.62 
 
 
491 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  28.73 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 
541 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
381 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.08 
 
 
477 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.61 
 
 
518 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
520 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  29.17 
 
 
512 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.06 
 
 
487 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 
514 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  30.96 
 
 
516 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  31.74 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.74 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.64 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  31.74 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.14 
 
 
451 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.18 
 
 
482 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.74 
 
 
451 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  33.44 
 
 
391 aa  137  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.28 
 
 
525 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  26.85 
 
 
504 aa  137  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.44 
 
 
451 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  27.91 
 
 
504 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.59 
 
 
491 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.14 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.71 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.56 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.43 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.35 
 
 
503 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 
518 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
495 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.54 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
551 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.1 
 
 
491 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.14 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.23 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
522 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.75 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 
525 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.47 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
522 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>