More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2636 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  71.05 
 
 
448 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
463 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.58 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1235  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.09 
 
 
479 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1206  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  53.52 
 
 
479 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.65 
 
 
451 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  53.03 
 
 
479 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.64 
 
 
386 aa  266  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.56 
 
 
447 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.28 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.88 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.28 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.99 
 
 
482 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.99 
 
 
482 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.14 
 
 
528 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.99 
 
 
482 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.95 
 
 
513 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.5 
 
 
482 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.7 
 
 
481 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.82 
 
 
500 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 
525 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.5 
 
 
481 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.21 
 
 
481 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.09 
 
 
482 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.58 
 
 
498 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.54 
 
 
492 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.76 
 
 
491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 
526 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.71 
 
 
494 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.3 
 
 
510 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
490 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.65 
 
 
481 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 
561 aa  156  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30 
 
 
490 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.89 
 
 
525 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 
523 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.12 
 
 
576 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 
525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.74 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
525 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
544 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 
519 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 
551 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30 
 
 
526 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  31.95 
 
 
391 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
501 aa  146  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 
526 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 
527 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
525 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
554 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  30.36 
 
 
561 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  26.74 
 
 
578 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
508 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  27.65 
 
 
562 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
518 aa  143  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  30.69 
 
 
564 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.15 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 
514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.15 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 
587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 
555 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 
505 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  26.45 
 
 
546 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
553 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.76 
 
 
453 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 
520 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.6 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.85 
 
 
479 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  30.97 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
515 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.37 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.94 
 
 
503 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
502 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
383 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  26.65 
 
 
575 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 
530 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.53 
 
 
451 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  26.65 
 
 
575 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  26.65 
 
 
575 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  25.87 
 
 
546 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  25.87 
 
 
546 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 
562 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.45 
 
 
474 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 
530 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
519 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
502 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  25 
 
 
560 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  26.84 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  27.14 
 
 
575 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  32.56 
 
 
504 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
534 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  26.84 
 
 
575 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  23.85 
 
 
578 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
521 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.83 
 
 
524 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>