More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3843 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  83.73 
 
 		 464 aa  797    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  68.99 
 
 		 472 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  70.15 
 
 		 475 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  69.66 
 
 		 470 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  96.33 
 
 		 491 aa  962    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 		 491 aa  1004    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  94.7 
 
 		 487 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  70.02 
 
 		 478 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  68.44 
 
 		 475 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  55.23 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  54.69 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  52.1 
 
 		 504 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.6 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  51.61 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  50.3 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.79 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.9 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.15 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.37 
 
 		 480 aa  266  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.34 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.15 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.81 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.08 
 
 		 476 aa  249  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 471 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 461 aa  246  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.28 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.93 
 
 		 478 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.46 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.86 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.28 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  33.84 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.84 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.31 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  33.84 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.62 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.35 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.86 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.31 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.09 
 
 		 485 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.74 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.06 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.17 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.61 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.94 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.14 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.46 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.14 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.51 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.92 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.3 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.12 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.25 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.85 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.73 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.42 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.68 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.22 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  26.21 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 		 524 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.1 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  27.73 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 517 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.65 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.8 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.48 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  25.83 
 
 		 570 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  25.63 
 
 		 578 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2055  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  27.2 
 
 		 543 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.23 
 
 		 494 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 544 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  25.63 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.29 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  26.25 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0581  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>