More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1103 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
465 aa  949    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.74 
 
 
487 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.93 
 
 
455 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.71 
 
 
455 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.38 
 
 
470 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.93 
 
 
455 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.49 
 
 
455 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.58 
 
 
455 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.73 
 
 
461 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.58 
 
 
453 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.11 
 
 
462 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  43.27 
 
 
451 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  43.27 
 
 
451 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  43.27 
 
 
451 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.86 
 
 
461 aa  348  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.05 
 
 
451 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.05 
 
 
451 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.05 
 
 
451 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.05 
 
 
451 aa  346  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.83 
 
 
451 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.38 
 
 
451 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.53 
 
 
471 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.53 
 
 
471 aa  342  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.48 
 
 
476 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.4 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.03 
 
 
471 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.09 
 
 
483 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.68 
 
 
468 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.36 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.05 
 
 
475 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.05 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.26 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.9 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.82 
 
 
470 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  38.07 
 
 
464 aa  269  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.55 
 
 
472 aa  269  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.27 
 
 
478 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.91 
 
 
484 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.33 
 
 
477 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.9 
 
 
504 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.35 
 
 
515 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.77 
 
 
504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.68 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.27 
 
 
504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.75 
 
 
480 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.23 
 
 
459 aa  227  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.44 
 
 
485 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.76 
 
 
478 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.34 
 
 
489 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.06 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.85 
 
 
482 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.57 
 
 
480 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.64 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.61 
 
 
482 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.82 
 
 
482 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.26 
 
 
482 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.61 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.61 
 
 
481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.67 
 
 
482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.61 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.13 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.39 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.61 
 
 
482 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.08 
 
 
474 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.47 
 
 
481 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.91 
 
 
473 aa  159  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.96 
 
 
524 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.81 
 
 
519 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.06 
 
 
490 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.28 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.37 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.29 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.6 
 
 
518 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.01 
 
 
518 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 
520 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 
520 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.13 
 
 
513 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.91 
 
 
492 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.91 
 
 
492 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.22 
 
 
518 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
490 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 
518 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 
518 aa  143  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
382 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
544 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 
534 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 
518 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2952  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 
541 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.31 
 
 
484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.6 
 
 
518 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 
520 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.6 
 
 
518 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
497 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.6 
 
 
518 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  26.92 
 
 
518 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.18 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  25.2 
 
 
549 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>