More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
392 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  51.25 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  54.15 
 
 
353 aa  272  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  47.95 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  49.84 
 
 
333 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  49.7 
 
 
396 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  47.55 
 
 
385 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  45.26 
 
 
381 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  51.89 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  45.81 
 
 
382 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  48.11 
 
 
386 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.71 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  48.66 
 
 
381 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.47 
 
 
361 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.04 
 
 
354 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.89 
 
 
354 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.89 
 
 
354 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  44.93 
 
 
434 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  44.77 
 
 
362 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 
366 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  49.34 
 
 
391 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  42.76 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 
444 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  49.71 
 
 
392 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  43.86 
 
 
384 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  48.68 
 
 
393 aa  196  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  47.38 
 
 
394 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.75 
 
 
513 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.36 
 
 
498 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
561 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.23 
 
 
528 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
490 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
499 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.1 
 
 
506 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.61 
 
 
553 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.42 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
510 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.77 
 
 
492 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.93 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.36 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 
529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  32.38 
 
 
509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.97 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.57 
 
 
515 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.65 
 
 
485 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.11 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.42 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.82 
 
 
484 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  31.53 
 
 
506 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  32.05 
 
 
520 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  31.34 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  32.18 
 
 
528 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
509 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
520 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.96 
 
 
477 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
522 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.54 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.05 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
506 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
508 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 
480 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  31.22 
 
 
533 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  29.55 
 
 
531 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
715 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.89 
 
 
510 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  31.34 
 
 
520 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  31.69 
 
 
571 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
502 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 
448 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.13 
 
 
482 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
499 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
546 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1128  hypothetical protein  28.61 
 
 
485 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.44 
 
 
489 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 
514 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 
523 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.39 
 
 
481 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.35 
 
 
451 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
478 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
521 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.39 
 
 
481 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.3 
 
 
500 aa  123  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 
521 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>