More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4006 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 594 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  36.53 
 
 		 636 aa  306  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 638 aa  293  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  33.44 
 
 		 632 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  33.78 
 
 		 632 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  33.85 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 647 aa  270  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 633 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  32.85 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 629 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  37.7 
 
 		 617 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  33 
 
 		 662 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  34.42 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  34.61 
 
 		 629 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  34.29 
 
 		 629 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  35.61 
 
 		 629 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 		 629 aa  254  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 628 aa  253  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  33.98 
 
 		 638 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  33.98 
 
 		 638 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  33.98 
 
 		 638 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 		 653 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 		 653 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 		 653 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  30.41 
 
 		 656 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  32.87 
 
 		 786 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 		 563 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 520 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 		 563 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.9 
 
 		 563 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 582 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.71 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.9 
 
 		 561 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.52 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 539 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 		 513 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 561 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.27 
 
 		 544 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  31.45 
 
 		 560 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 549 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 521 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 		 518 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.29 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 590 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 591 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.37 
 
 		 587 aa  187  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 521 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 536 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.01 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  30.99 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  31.16 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  28.06 
 
 		 596 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 502 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 512 aa  183  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  31.31 
 
 		 560 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.25 
 
 		 481 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.12 
 
 		 585 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 485 aa  183  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 518 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  29.48 
 
 		 576 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  27.99 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.67 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>