More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2913 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  66.4 
 
 
629 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  67.73 
 
 
632 aa  861    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  66.24 
 
 
629 aa  845    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  63.8 
 
 
629 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  66.08 
 
 
629 aa  847    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  100 
 
 
629 aa  1295    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  70.9 
 
 
628 aa  907    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  42.93 
 
 
633 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  43 
 
 
632 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  42.64 
 
 
632 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  39.47 
 
 
653 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  39.47 
 
 
653 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  39.47 
 
 
653 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  38.51 
 
 
656 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  41.03 
 
 
786 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  37.15 
 
 
662 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
658 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  38.04 
 
 
636 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
638 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
647 aa  331  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
626 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  37.89 
 
 
629 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  35.6 
 
 
617 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  32.82 
 
 
660 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 
638 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  34.15 
 
 
638 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  33.8 
 
 
638 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
559 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
569 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
566 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
582 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 
557 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
594 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
583 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 
561 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 
561 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
561 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 
561 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 
563 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 
563 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.29 
 
 
582 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
503 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
564 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 
491 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 
549 aa  230  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
577 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 
590 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 
520 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
539 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
577 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
565 aa  227  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
578 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.79 
 
 
515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 
591 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  220  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  220  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.75 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
591 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
452 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
577 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
573 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
577 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.14 
 
 
566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.22 
 
 
585 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
554 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
568 aa  213  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
566 aa  213  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.47 
 
 
514 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 
543 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
487 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
564 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 
564 aa  210  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.6 
 
 
569 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
583 aa  210  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.63 
 
 
560 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
558 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.016837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
490 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
512 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
569 aa  208  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
588 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 
567 aa  207  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>