More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0929 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  92.37 
 
 		 629 aa  1197    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  99.52 
 
 		 629 aa  1271    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  66.4 
 
 		 629 aa  848    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  65.45 
 
 		 628 aa  852    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 629 aa  1279    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  67.94 
 
 		 632 aa  859    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  68.2 
 
 		 629 aa  870    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  42.35 
 
 		 633 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  41.43 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  39.29 
 
 		 653 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  39.29 
 
 		 653 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  39.29 
 
 		 653 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  41.98 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  38.45 
 
 		 662 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  39.87 
 
 		 656 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  41.85 
 
 		 786 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  42.41 
 
 		 658 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 658 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  39.55 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 647 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 626 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  35.39 
 
 		 617 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  32.87 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  35.39 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 525 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 		 561 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.4 
 
 		 561 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 		 563 aa  237  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 		 561 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.8 
 
 		 561 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.82 
 
 		 561 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 594 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 566 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 557 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 452 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 577 aa  223  8e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 591 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 503 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 559 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 549 aa  216  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 549 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 561 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.48 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  32.49 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  32.8 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 569 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 564 aa  210  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 585 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 571 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 539 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.9 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 510 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.51 
 
 		 560 aa  207  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 584 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 490 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.72 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.96 
 
 		 562 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 590 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 583 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3552  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 550 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.5 
 
 		 567 aa  203  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 584 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 591 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>