More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1134 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  99.85 
 
 		 658 aa  1307    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  94.05 
 
 		 786 aa  1204    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  52.9 
 
 		 656 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  54.52 
 
 		 653 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  54.52 
 
 		 653 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  54.52 
 
 		 653 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  53.67 
 
 		 662 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 658 aa  1308    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  48.97 
 
 		 633 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  48.81 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  47.87 
 
 		 632 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  40.94 
 
 		 628 aa  445  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  42.57 
 
 		 629 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  41.71 
 
 		 632 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  42.41 
 
 		 629 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  42.06 
 
 		 629 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  40.44 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  39.34 
 
 		 636 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  39.75 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  41.55 
 
 		 626 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 647 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  49.14 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  37.87 
 
 		 638 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  37.87 
 
 		 638 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  38.74 
 
 		 638 aa  349  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 660 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5810  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  57.69 
 
 		 307 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 561 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 557 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 577 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.51 
 
 		 561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 561 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 582 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 561 aa  231  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 		 561 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 577 aa  229  9e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 563 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 563 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 579 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 539 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 565 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 549 aa  221  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 551 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 527 aa  218  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 485 aa  214  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 564 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.39 
 
 		 594 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 521 aa  211  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 532 aa  211  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 511 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 577 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.06 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 499 aa  210  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  38.54 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 561 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 567 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 567 aa  206  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 549 aa  206  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 568 aa  204  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 585 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 583 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.67 
 
 		 510 aa  204  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 		 510 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 		 510 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 514 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 569 aa  203  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.67 
 
 		 510 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>