More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2376 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  55.38 
 
 
653 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  94.41 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  100 
 
 
786 aa  1566    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  55.38 
 
 
653 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  55.38 
 
 
653 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  53.67 
 
 
656 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  94.57 
 
 
658 aa  1156    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  52.89 
 
 
662 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  48.82 
 
 
633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  49.05 
 
 
632 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  47.87 
 
 
632 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  41.46 
 
 
628 aa  445  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  41.52 
 
 
632 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  41.75 
 
 
629 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  41.85 
 
 
629 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  41.03 
 
 
629 aa  432  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  41.57 
 
 
629 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  39.93 
 
 
636 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  38.98 
 
 
629 aa  419  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 
626 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.87 
 
 
647 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 
638 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  50.12 
 
 
452 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 
629 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  35.35 
 
 
660 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  37.32 
 
 
638 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  37.05 
 
 
638 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  37.05 
 
 
638 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  35.4 
 
 
617 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
525 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
520 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5810  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  58.12 
 
 
307 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
577 aa  251  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
557 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
559 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
561 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 
566 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.73 
 
 
563 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.73 
 
 
563 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 
577 aa  235  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.73 
 
 
582 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 
561 aa  234  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
582 aa  233  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
561 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 
561 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 
561 aa  231  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 
563 aa  229  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 
563 aa  229  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.93 
 
 
561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
549 aa  227  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 
539 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 
594 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
564 aa  223  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  40.05 
 
 
503 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
565 aa  223  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 
514 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 
508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
490 aa  218  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 
584 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
551 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 
564 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 
569 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 
549 aa  214  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.7 
 
 
491 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
499 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
583 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
485 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
527 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
521 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
561 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
554 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
564 aa  211  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  39.46 
 
 
552 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.68 
 
 
513 aa  210  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
532 aa  210  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
512 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 
518 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
567 aa  208  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 
567 aa  207  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 
510 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 
506 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
521 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.8 
 
 
510 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.62 
 
 
510 aa  206  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
568 aa  206  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 
506 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
492 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
584 aa  205  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
583 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.62 
 
 
510 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
543 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.62 
 
 
510 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.62 
 
 
510 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>