More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0723 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 626 aa  1233    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  46.04 
 
 		 632 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  45.96 
 
 		 632 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  47.91 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  44.89 
 
 		 633 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  44.25 
 
 		 638 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  43.91 
 
 		 638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  43.91 
 
 		 638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  40.58 
 
 		 662 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  43.9 
 
 		 656 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  40.41 
 
 		 653 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  40.41 
 
 		 653 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  41.6 
 
 		 786 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  40.41 
 
 		 653 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  40.52 
 
 		 636 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  41.55 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 		 638 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  37.54 
 
 		 628 aa  357  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  38.13 
 
 		 629 aa  355  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  38.92 
 
 		 632 aa  346  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  37.82 
 
 		 629 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  36.72 
 
 		 629 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  36.83 
 
 		 629 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  36.97 
 
 		 629 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  36.16 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 617 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 		 525 aa  276  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 520 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 503 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 551 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 452 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 559 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.76 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.23 
 
 		 563 aa  231  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.23 
 
 		 563 aa  230  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 561 aa  230  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 561 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.73 
 
 		 561 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 563 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 563 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 582 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.45 
 
 		 491 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 514 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 565 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 561 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 569 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 549 aa  210  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 490 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 583 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 508 aa  205  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 564 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  204  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 564 aa  203  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 557 aa  203  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 549 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 521 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.87 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.24 
 
 		 510 aa  197  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 591 aa  197  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 590 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 518 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 506 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 522 aa  193  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>