More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2984 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 629 aa  1255    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  53.12 
 
 		 638 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  53.12 
 
 		 638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  53.12 
 
 		 638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  47.91 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  41.93 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  42.61 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  41.05 
 
 		 633 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  39.38 
 
 		 656 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  39.69 
 
 		 662 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  38.92 
 
 		 653 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  38.92 
 
 		 653 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  38.92 
 
 		 653 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  39.4 
 
 		 786 aa  351  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 		 647 aa  336  9e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  36.57 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 638 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  36.18 
 
 		 660 aa  323  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  36.49 
 
 		 628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  37.89 
 
 		 629 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 632 aa  309  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  35.19 
 
 		 629 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  35.55 
 
 		 629 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  36.28 
 
 		 617 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 520 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.36 
 
 		 491 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 503 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 514 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 551 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 561 aa  213  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.82 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 563 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 		 561 aa  210  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 561 aa  210  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 569 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 577 aa  205  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 566 aa  205  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.14 
 
 		 510 aa  204  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 559 aa  203  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.95 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.25 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 565 aa  200  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.76 
 
 		 510 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 490 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 564 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 508 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.49 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 487 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 549 aa  193  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 584 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 527 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 561 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 452 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  30.88 
 
 		 526 aa  191  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 521 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 518 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.62 
 
 		 503 aa  190  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.04 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  29.53 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>