More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1237 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
533 aa  1097    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.79 
 
 
555 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
514 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
490 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 
556 aa  306  7e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
520 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
521 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 
512 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
512 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.43 
 
 
510 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
508 aa  291  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
590 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
591 aa  290  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
551 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 
514 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.03 
 
 
515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 
518 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
527 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
559 aa  280  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
511 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.3 
 
 
508 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 
513 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
511 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 
510 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 
510 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 
510 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
521 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
558 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00018941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
519 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 
510 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 
577 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
662 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
499 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
507 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  30.07 
 
 
565 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
561 aa  270  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  30.87 
 
 
594 aa  269  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
594 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
532 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 
577 aa  266  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
584 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
577 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.08 
 
 
561 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
579 aa  264  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
588 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
566 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
561 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
559 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 
561 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
582 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
520 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.36 
 
 
565 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
561 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.36 
 
 
565 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
564 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.55 
 
 
565 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
578 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
539 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.87 
 
 
561 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
563 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
561 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 
563 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
563 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
563 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
582 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
583 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
561 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
583 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
506 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
561 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
561 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 
514 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 
565 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
561 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
498 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
561 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 
561 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
557 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 
562 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
508 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
525 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 
559 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
519 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 
563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  30.02 
 
 
557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>