More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1408 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  100 
 
 
391 aa  754    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  62.69 
 
 
444 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  59.47 
 
 
382 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  57.85 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  58.1 
 
 
391 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  51.37 
 
 
392 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  48.08 
 
 
385 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  49.85 
 
 
383 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  51.8 
 
 
386 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  49.68 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 
434 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.33 
 
 
354 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.33 
 
 
354 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.55 
 
 
394 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  43 
 
 
372 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.14 
 
 
354 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.88 
 
 
345 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 
396 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
381 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  47.52 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.66 
 
 
361 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 
353 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
366 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  53.15 
 
 
392 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.45 
 
 
362 aa  172  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.35 
 
 
384 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 
428 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.92 
 
 
393 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
490 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.14 
 
 
435 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.76 
 
 
513 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.14 
 
 
463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.85 
 
 
473 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.76 
 
 
528 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
520 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.32 
 
 
492 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 
430 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.4 
 
 
494 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.76 
 
 
498 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.48 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.53 
 
 
501 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
553 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 
553 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  35.84 
 
 
553 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.48 
 
 
484 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.24 
 
 
492 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.24 
 
 
492 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.24 
 
 
474 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.27 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.27 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.17 
 
 
481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.59 
 
 
482 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.59 
 
 
481 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.98 
 
 
482 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.98 
 
 
482 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.3 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  32.26 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.78 
 
 
489 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  32.06 
 
 
506 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.44 
 
 
481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 
521 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
495 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.68 
 
 
500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.02 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.3 
 
 
482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
955 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 
512 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
508 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
527 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.41 
 
 
514 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.46 
 
 
506 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
517 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.4 
 
 
482 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1628  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
395 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
546 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
507 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
520 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
536 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.61 
 
 
479 aa  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  31.53 
 
 
539 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.07 
 
 
510 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.82 
 
 
482 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.37 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.37 
 
 
504 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.17 
 
 
574 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28 
 
 
504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.05 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.37 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.82 
 
 
478 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32 
 
 
515 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.96 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  30 
 
 
506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 
1043 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.05 
 
 
475 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.05 
 
 
470 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
522 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>