More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2531 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 537 aa  1102    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  47.17 
 
 		 555 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  47.71 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 		 555 aa  485  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  49.33 
 
 		 530 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  47.34 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  46.35 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 		 609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  45.74 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  45.74 
 
 		 528 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  45.94 
 
 		 567 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  45.35 
 
 		 522 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  45.26 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  45.54 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  45.54 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  45.54 
 
 		 522 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  45.54 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  44.57 
 
 		 563 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  45.35 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  44.14 
 
 		 586 aa  458  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  44.96 
 
 		 528 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  44.83 
 
 		 528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  43.98 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  42.75 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  43.57 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  42.8 
 
 		 552 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 		 557 aa  428  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  42.41 
 
 		 582 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 		 546 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  43.97 
 
 		 549 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  43.4 
 
 		 549 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 551 aa  422  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  41.65 
 
 		 559 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  40.84 
 
 		 593 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  41.37 
 
 		 550 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  41.74 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  40.93 
 
 		 594 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 		 552 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 534 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  40.29 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  42.88 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 		 508 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  38.14 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 563 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  37.59 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 		 567 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 568 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  40.53 
 
 		 568 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 564 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 564 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  39.77 
 
 		 567 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  39.73 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 535 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.11 
 
 		 572 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  40.3 
 
 		 567 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 572 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 576 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 559 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  40.38 
 
 		 567 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  40.38 
 
 		 567 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  40.38 
 
 		 567 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>