More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1447 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  84.39 
 
 		 628 aa  1089    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  84.78 
 
 		 624 aa  1092    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  60.73 
 
 		 598 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  78.51 
 
 		 614 aa  949    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  84.78 
 
 		 624 aa  1091    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  100 
 
 		 608 aa  1263    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  67.86 
 
 		 585 aa  788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  66.78 
 
 		 574 aa  782    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  84.26 
 
 		 629 aa  1088    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  64.9 
 
 		 571 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  65.52 
 
 		 563 aa  753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  76.54 
 
 		 613 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  78.84 
 
 		 608 aa  971    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  66.32 
 
 		 564 aa  784    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  77.49 
 
 		 608 aa  961    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  60.21 
 
 		 564 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  70 
 
 		 573 aa  801    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  61.42 
 
 		 554 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  46.78 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  47.66 
 
 		 546 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  46.53 
 
 		 542 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  47.14 
 
 		 546 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  48.34 
 
 		 544 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.37 
 
 		 564 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  42.46 
 
 		 564 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  41.7 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  40.86 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  41.65 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  38.95 
 
 		 564 aa  399  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  41.11 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  36.75 
 
 		 555 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  31.65 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.34 
 
 		 922 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 927 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.39 
 
 		 899 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 915 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 861 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 875 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.67 
 
 		 978 aa  167  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.76 
 
 		 922 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 525 aa  163  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 		 555 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  23.7 
 
 		 555 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  24.84 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 548 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 552 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  24.3 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2202  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  29.6 
 
 		 483 aa  97.8  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  22.85 
 
 		 525 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  24.17 
 
 		 577 aa  94.7  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.1 
 
 		 579 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  23.23 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  24.03 
 
 		 506 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  23.31 
 
 		 583 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  22.73 
 
 		 518 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 		 498 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  23.14 
 
 		 662 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 		 496 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.17 
 
 		 514 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6839  acyl-CoA synthetase  27.69 
 
 		 503 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189698  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  21.31 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  23.11 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 553 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  24.23 
 
 		 504 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  24.84 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3733  amino acid adenylation  22.38 
 
 		 2378 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.34 
 
 		 500 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  24.22 
 
 		 506 aa  87.8  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 536 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 		 525 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  24.08 
 
 		 550 aa  87  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.95 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  21.7 
 
 		 1643 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  23.64 
 
 		 564 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0322  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.68 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  23.66 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  22.79 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  22.09 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  23.76 
 
 		 2571 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1101  AMP-dependent synthetase and ligase  24.19 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  25.95 
 
 		 1304 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  23.76 
 
 		 2571 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  22.08 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  22.48 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  22.86 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  23.37 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  23.21 
 
 		 3291 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3068  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  22.71 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>