More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3071 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
3291 aa  6787    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  32.9 
 
 
5213 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  31.71 
 
 
2875 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.02 
 
 
2883 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  31.82 
 
 
3432 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  31.7 
 
 
5654 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.13 
 
 
4968 aa  665    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.68 
 
 
4037 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  31.19 
 
 
2878 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.07 
 
 
4960 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  31.65 
 
 
4991 aa  624  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.85 
 
 
7712 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  30.66 
 
 
1661 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.79 
 
 
4960 aa  617  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.79 
 
 
4747 aa  611  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  31.54 
 
 
2625 aa  610  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  30.95 
 
 
2596 aa  607  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 
3942 aa  607  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.78 
 
 
4332 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  31.84 
 
 
5467 aa  607  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.09 
 
 
4136 aa  604  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 
2626 aa  601  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.96 
 
 
3018 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.98 
 
 
5230 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.3 
 
 
4336 aa  597  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  27.74 
 
 
4080 aa  592  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.68 
 
 
2666 aa  594  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  29.62 
 
 
6176 aa  586  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.75 
 
 
4336 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.14 
 
 
9175 aa  581  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.83 
 
 
4317 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.34 
 
 
4342 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.98 
 
 
2883 aa  577  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.66 
 
 
5149 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.34 
 
 
4317 aa  573  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.81 
 
 
2571 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  30.18 
 
 
2606 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.81 
 
 
2571 aa  573  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  30.06 
 
 
4318 aa  570  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  28.51 
 
 
2971 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  30.25 
 
 
4483 aa  568  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.28 
 
 
4502 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  30.23 
 
 
4342 aa  570  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  29.87 
 
 
3962 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.1 
 
 
4317 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.44 
 
 
4317 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  30.01 
 
 
3180 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  27.24 
 
 
6202 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.16 
 
 
6404 aa  543  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  30.06 
 
 
2651 aa  543  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  29.15 
 
 
3224 aa  539  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.85 
 
 
5328 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  31.38 
 
 
4106 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  30.01 
 
 
3235 aa  531  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.72 
 
 
2156 aa  530  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 
1069 aa  526  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  29.49 
 
 
3231 aa  524  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  32.98 
 
 
2156 aa  522  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.94 
 
 
3404 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.16 
 
 
2156 aa  517  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 
1870 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.69 
 
 
1870 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.19 
 
 
3086 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 
1078 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  29.92 
 
 
2845 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.56 
 
 
3086 aa  493  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  28.97 
 
 
3231 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 
3231 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  28.15 
 
 
2628 aa  487  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  29.25 
 
 
3221 aa  484  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  30.71 
 
 
3208 aa  479  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  28.18 
 
 
2979 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  28.27 
 
 
2979 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  28.02 
 
 
3219 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 
1454 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  27.27 
 
 
2967 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  28.28 
 
 
3227 aa  466  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  33.22 
 
 
1990 aa  467  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  28.4 
 
 
2979 aa  467  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  24.67 
 
 
3044 aa  460  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  33.68 
 
 
3230 aa  458  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  25.16 
 
 
3395 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  28.18 
 
 
3227 aa  457  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  29.22 
 
 
2706 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  28.24 
 
 
11233 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  25.56 
 
 
2295 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  28.66 
 
 
5750 aa  450  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.79 
 
 
2033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  34.12 
 
 
1339 aa  437  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  30.01 
 
 
3219 aa  433  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.02 
 
 
3498 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.63 
 
 
3294 aa  431  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.63 
 
 
3297 aa  431  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.63 
 
 
3294 aa  431  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  31.49 
 
 
3287 aa  427  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  31.47 
 
 
2183 aa  427  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  31.49 
 
 
3290 aa  427  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  31.49 
 
 
3290 aa  427  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  30.98 
 
 
1314 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  27.09 
 
 
3650 aa  423  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>