More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1958 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 
1990 aa  976    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  44.02 
 
 
3470 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  47.87 
 
 
2628 aa  2268    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 
1553 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.82 
 
 
4317 aa  1691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.14 
 
 
5467 aa  1690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.95 
 
 
5953 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.6 
 
 
6889 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.29 
 
 
2385 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.46 
 
 
4336 aa  1793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  52.04 
 
 
3432 aa  1682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  86.95 
 
 
2625 aa  4705    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  59.06 
 
 
2151 aa  1137    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  65.9 
 
 
2875 aa  2263    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  43.64 
 
 
3231 aa  1274    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  41.15 
 
 
5929 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  41.21 
 
 
3290 aa  1607    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  36.94 
 
 
1525 aa  838    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  32.94 
 
 
2979 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.67 
 
 
2385 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  37.1 
 
 
2385 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.53 
 
 
2543 aa  855    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  30.45 
 
 
3044 aa  884    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  27.14 
 
 
2295 aa  843    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  37.26 
 
 
2385 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.9 
 
 
3208 aa  1405    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  35.6 
 
 
2883 aa  1296    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  46.12 
 
 
5230 aa  2018    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  41.9 
 
 
5328 aa  1787    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  35.4 
 
 
1528 aa  798    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  41.69 
 
 
4336 aa  1805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  34.39 
 
 
3962 aa  1179    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  100 
 
 
2666 aa  5416    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  61.38 
 
 
2154 aa  1208    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  65.82 
 
 
2883 aa  2252    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.56 
 
 
2370 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  43.06 
 
 
5926 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  40.65 
 
 
9498 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  39.4 
 
 
5372 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  42.55 
 
 
5469 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  43 
 
 
13537 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.71 
 
 
6676 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.17 
 
 
3629 aa  998    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  40.96 
 
 
2867 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  39.54 
 
 
6999 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  39.6 
 
 
4468 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.71 
 
 
3308 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.81 
 
 
3498 aa  1267    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.07 
 
 
2033 aa  1219    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  41.43 
 
 
6081 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  37.73 
 
 
2386 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  41.17 
 
 
3287 aa  1615    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  47.25 
 
 
1405 aa  839    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  33.01 
 
 
2979 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.73 
 
 
4317 aa  1687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  42.76 
 
 
6072 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  40.13 
 
 
4572 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  46.03 
 
 
4136 aa  2059    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  46.76 
 
 
5654 aa  2157    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  46.15 
 
 
4502 aa  2128    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  47.17 
 
 
1383 aa  835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  33.05 
 
 
2979 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 
3395 aa  1246    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  44.21 
 
 
3291 aa  709    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  38.47 
 
 
1661 aa  965    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  43.61 
 
 
4332 aa  1359    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  40.48 
 
 
3219 aa  1612    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  41 
 
 
3294 aa  1603    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.67 
 
 
2385 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  42.99 
 
 
4037 aa  1991    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  37.37 
 
 
1138 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  32.89 
 
 
2967 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  30.24 
 
 
3650 aa  859    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  41.54 
 
 
3296 aa  1179    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.29 
 
 
1833 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.3 
 
 
2605 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  32.8 
 
 
4606 aa  1014    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  36.05 
 
 
2971 aa  1030    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  41.13 
 
 
3180 aa  1713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 
6404 aa  1385    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  37.96 
 
 
2596 aa  1027    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  40.92 
 
 
3231 aa  1628    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  27 
 
 
1992 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  40.55 
 
 
3227 aa  1605    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  42.07 
 
 
8914 aa  690    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.17 
 
 
3176 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  33.12 
 
 
3018 aa  1172    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  44.92 
 
 
4342 aa  1359    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  44.83 
 
 
4342 aa  1360    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  45.51 
 
 
5149 aa  2073    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  35.85 
 
 
2189 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  46.82 
 
 
2448 aa  814    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  40.92 
 
 
3231 aa  1628    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  42.43 
 
 
3235 aa  1771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  41.21 
 
 
3290 aa  1607    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  36.91 
 
 
1129 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  42.43 
 
 
2651 aa  1861    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  41 
 
 
3294 aa  1603    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.71 
 
 
4383 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  53.01 
 
 
4991 aa  1702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>