More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1101 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1101  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 518 aa  1023    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1713  AMP-dependent synthetase and ligase  96.72 
 
 		 519 aa  959    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  96.72 
 
 		 519 aa  978    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 552 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 487 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.93 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 536 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 508 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.5 
 
 		 510 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 507 aa  177  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  30.15 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  31.51 
 
 		 536 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.32 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 561 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  29.52 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 528 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 563 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  28.39 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 519 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 541 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  29.49 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 5154 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 509 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 662 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  31.82 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  32.22 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 550 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.39 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.32 
 
 		 561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  31.36 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.32 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 498 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1557  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6272  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417798  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  28.33 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  29.28 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.5 
 
 		 561 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  27.53 
 
 		 549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0265  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73102  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 566 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5547  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 544 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.730505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.12 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.54 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  32.06 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  28.14 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.12 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.08 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  28.46 
 
 		 555 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.12 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>