More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7956 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  65.4 
 
 
287 aa  377  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  62.8 
 
 
296 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  55.86 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  42.96 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  46.57 
 
 
294 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  44.6 
 
 
300 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  43.32 
 
 
300 aa  214  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  45.65 
 
 
298 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  40.21 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  35.53 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  35.53 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.86 
 
 
286 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 
314 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
294 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  27.3 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
309 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  33.86 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.76 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.93 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  29.72 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.13 
 
 
639 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  35.09 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  42.86 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  32.12 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  38.89 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  25.94 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  27.27 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  24.75 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  44.33 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  40.74 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.59 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  38.53 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  26.18 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  35.59 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  29.24 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  29.24 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  29.24 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  24.91 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>