More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4949 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  68.33 
 
 		 310 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  66.45 
 
 		 302 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  64.33 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  52.17 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  53.51 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  52 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  57.67 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  48.68 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  48 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  52.33 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  51.16 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  48 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  45.07 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  46 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.3 
 
 		 461 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 		 482 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.03 
 
 		 484 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  54.03 
 
 		 118 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.67 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  32.5 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  29.85 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.32 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  38.86 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.17 
 
 		 475 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  36.87 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  31.71 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.03 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  32.21 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.58 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  28.16 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  41.6 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  30.18 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  27.72 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  27.01 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  30 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.04 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.56 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.56 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  40.52 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.27 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  27.8 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>