More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2671 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  58.16 
 
 
303 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  56.46 
 
 
302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  54.27 
 
 
299 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  53.68 
 
 
302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  53.4 
 
 
306 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  50 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  55.85 
 
 
298 aa  318  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  50.52 
 
 
300 aa  295  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  51 
 
 
303 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  49 
 
 
310 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  51.16 
 
 
304 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  51.16 
 
 
304 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  51.16 
 
 
304 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  48.33 
 
 
302 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 
289 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
299 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.21 
 
 
461 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.13 
 
 
482 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  35.5 
 
 
314 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  57.72 
 
 
118 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.9 
 
 
363 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.95 
 
 
484 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
300 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.17 
 
 
411 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 
308 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
301 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
303 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
295 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
320 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.97 
 
 
318 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
293 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
298 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
302 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
297 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  43.07 
 
 
307 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
294 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
302 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
294 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
302 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
290 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
302 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  30.9 
 
 
304 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 
304 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
304 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  30.16 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.49 
 
 
475 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  28.06 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.5 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  27.88 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  40.28 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  27.88 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  27.54 
 
 
301 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.29 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  41.38 
 
 
409 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  31.51 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02800  haloalkane dehalogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01700)  28.28 
 
 
485 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.417921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.31 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 
336 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  29.41 
 
 
296 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.8 
 
 
369 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  44.64 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  29.58 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  30.3 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  35.65 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>