More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0828 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 323 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  61.18 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  58.36 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  56.89 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  57.24 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  57.59 
 
 		 303 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  55.63 
 
 		 334 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  56.99 
 
 		 321 aa  351  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  52.82 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  53.96 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.52 
 
 		 323 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  54.14 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  50.72 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  51.76 
 
 		 289 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  48.8 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  48.28 
 
 		 306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  48.93 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  51.08 
 
 		 284 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 		 301 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  48.2 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  48.2 
 
 		 289 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  46.88 
 
 		 283 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  47.16 
 
 		 284 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  46.76 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  45.72 
 
 		 323 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  49.28 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  44.18 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 		 288 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  42.43 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  44.71 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  44.71 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  43.99 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  44.41 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  43.92 
 
 		 296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.86 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.68 
 
 		 639 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  46.5 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  42.66 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  43.26 
 
 		 287 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  45.04 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 		 374 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  39.06 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  37.83 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  49.25 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  39.66 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  27.02 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  47.13 
 
 		 99 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.83 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.37 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  34.29 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.74 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  24.23 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  24.23 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  24.23 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.24 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  24.04 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.83 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  37.29 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  37.39 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>