More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1077 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  73.31 
 
 
284 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  72.04 
 
 
284 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  71.43 
 
 
283 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  72.14 
 
 
284 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  69.64 
 
 
281 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  60.28 
 
 
297 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  59.14 
 
 
356 aa  359  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  60.71 
 
 
293 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  58.57 
 
 
336 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  60.66 
 
 
289 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.29 
 
 
639 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  60.14 
 
 
293 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  58.21 
 
 
336 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.86 
 
 
334 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 
308 aa  335  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  55.87 
 
 
296 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  56.99 
 
 
323 aa  333  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  55.83 
 
 
311 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  55.16 
 
 
296 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  55.79 
 
 
321 aa  329  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  56.54 
 
 
337 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  54.84 
 
 
296 aa  328  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  54.84 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  55.91 
 
 
321 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  55.2 
 
 
323 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 
294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  52.98 
 
 
300 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
315 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  49.1 
 
 
300 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 
283 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 
289 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  48.2 
 
 
323 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.58 
 
 
303 aa  288  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  49.27 
 
 
296 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.25 
 
 
290 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  47.24 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
287 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
309 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 
374 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 
293 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  49.47 
 
 
291 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 
288 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
335 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  40.91 
 
 
313 aa  226  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 
290 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
296 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
289 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
297 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
297 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  47.73 
 
 
409 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  66.3 
 
 
99 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  32.53 
 
 
307 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
304 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 
304 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  31.38 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  29.93 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  29.68 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  30.45 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
297 aa  89  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  37.3 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  41.53 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  41.74 
 
 
302 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  37.86 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  38.26 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  29.39 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  29.39 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  29.39 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  26.28 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  39.13 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  26.9 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  38.46 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>