More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  73.52 
 
 
290 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  73.52 
 
 
290 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  73.52 
 
 
290 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  66.78 
 
 
293 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  64.11 
 
 
287 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  67.83 
 
 
291 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  56.1 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  55.4 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  53.17 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.57 
 
 
323 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 
294 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  53.15 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  53.85 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  52.8 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  53.17 
 
 
289 aa  301  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  54.74 
 
 
289 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  51.23 
 
 
321 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  53 
 
 
284 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  51.4 
 
 
337 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  49.65 
 
 
329 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  53 
 
 
284 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  52.1 
 
 
311 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  53.07 
 
 
296 aa  291  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  51.24 
 
 
284 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  51.25 
 
 
290 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  47.59 
 
 
303 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 
283 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  51.23 
 
 
296 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.22 
 
 
639 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
281 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  46.85 
 
 
296 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
315 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  47.14 
 
 
300 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  48.73 
 
 
356 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  43.86 
 
 
323 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  48.78 
 
 
323 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 
301 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  47.99 
 
 
288 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  49.48 
 
 
293 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  44.64 
 
 
283 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
293 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 
309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  45.68 
 
 
374 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  45.67 
 
 
323 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  41.67 
 
 
306 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  45.55 
 
 
296 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
335 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
303 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  41.61 
 
 
305 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  37.92 
 
 
313 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
296 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
290 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
289 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 
297 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  59.38 
 
 
409 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
275 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 
99 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  45.76 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  45.76 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  44.92 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
303 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.4 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  39.52 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  40.83 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>