More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3633 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
315 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  61.18 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  56.19 
 
 
321 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  57.62 
 
 
336 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  57.28 
 
 
336 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  56.95 
 
 
334 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  54.25 
 
 
303 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  54.13 
 
 
311 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 
323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  52.15 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 
321 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  52.79 
 
 
329 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  52.08 
 
 
300 aa  328  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  52.13 
 
 
337 aa  318  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  50.64 
 
 
306 aa  316  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  49.51 
 
 
284 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
294 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  50.49 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  52.35 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  52.13 
 
 
289 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  48.2 
 
 
284 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  50.83 
 
 
301 aa  305  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  49.35 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  49.34 
 
 
283 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  46.71 
 
 
290 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  45.05 
 
 
356 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  47.85 
 
 
297 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  48.69 
 
 
300 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  47.39 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
289 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  46.56 
 
 
296 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 
290 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 
290 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 
290 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 
293 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.88 
 
 
290 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  43.71 
 
 
323 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  43.63 
 
 
296 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  43.31 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  43.89 
 
 
293 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  43.09 
 
 
323 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  44.08 
 
 
293 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  44.08 
 
 
296 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.55 
 
 
639 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
308 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  41.97 
 
 
287 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  40.26 
 
 
335 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  43.89 
 
 
291 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
374 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
303 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  37.34 
 
 
313 aa  217  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
290 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  37.75 
 
 
305 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 
289 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  35.18 
 
 
297 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  51.52 
 
 
409 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
99 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
278 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
298 aa  89  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  26.98 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  39.45 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  37.4 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  40.18 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.36 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  25.23 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  23.61 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.58 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  35.71 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  36.75 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>