More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1208 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  70.48 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  39.64 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  29.92 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  41.67 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.83 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  28.52 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 345 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  26.95 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  27.61 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  26.97 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  40.37 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.44 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.91 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.62 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.01 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.71 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.43 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  37.61 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.43 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.33 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.96 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  29.45 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>