More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2105 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
256 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  36.13 
 
 
264 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.1 
 
 
246 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  36.36 
 
 
258 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  35.17 
 
 
241 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
263 aa  92  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
396 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.05 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
236 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  34.82 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
216 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.21 
 
 
277 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
266 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.76 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.2 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.96 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
621 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.05 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.05 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  32.68 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.28 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  33.05 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  33.05 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  33.05 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  33.05 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.63 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.54 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.28 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  27.91 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.19 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  29.34 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.34 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.14 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.34 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.34 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  27.56 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.34 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.34 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.9 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.74 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.44 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  24.9 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>