More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1008 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  35.04 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  31.65 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  35.77 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  35.77 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  35.37 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  39.57 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  38.17 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  35.2 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  34 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  38.72 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.49 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  31.67 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  33.92 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  34.39 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  34.28 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 311 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  31.21 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  31.21 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  31.21 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  31.21 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  31.21 
 
 		 336 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  31.21 
 
 		 309 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  30.85 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  31.67 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 292 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  30.83 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  29.72 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  29.27 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  30.96 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  31.84 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  28.76 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  29.91 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  29.54 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  26.87 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  27.31 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  29.06 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.87 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  33.19 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  26.97 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  28.11 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3816  hypothetical protein  31.36 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  29.11 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  42.2 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  42.2 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  30.42 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  42.2 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  29.11 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  29.11 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  29.34 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  25.97 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  28.16 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  27.63 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  29.74 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  28.45 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  28.21 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  28.63 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  27.76 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  26.97 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  29.31 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  28.86 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  28.76 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  28.75 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  28.33 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  29.11 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  38.26 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  27.27 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  24.35 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  30.38 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  27.43 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  27.43 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  30.51 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  28.81 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  28.27 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  37.38 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>