More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1540 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  66.4 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  47.19 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  46.03 
 
 		 246 aa  178  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  46.55 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  38.86 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.13 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.04 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  35.39 
 
 		 216 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  38.16 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.37 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  39.39 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  34.57 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  28.81 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  21.74 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2038  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0252314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1813  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1770  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.841886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.02 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1989  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1399299999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1953  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00974943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  42.86 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  23.74 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.88 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  23.21 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  24.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  36.96 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.2 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.63 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  24.42 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.42 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  24.42 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.96 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  31.16 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  27.42 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.42 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  27.42 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  34.65 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.69 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>