More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1561 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  85.4 
 
 		 274 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  86.13 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  68.4 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  68.66 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  62.96 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  58.65 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  62.59 
 
 		 277 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  54.89 
 
 		 270 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  52.61 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  54.07 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  51.49 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  51.33 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  51.81 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  50 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  50.73 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 		 269 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  48.89 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  48.67 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  47.67 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.72 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.46 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  22.62 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.63 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  23.31 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  20.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  20.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  20.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.4 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.19 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.33 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>