More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2998 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  73.78 
 
 
273 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  73.78 
 
 
273 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  72.06 
 
 
272 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  68.91 
 
 
269 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  64.98 
 
 
279 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  62.59 
 
 
268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  59.56 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  58.52 
 
 
268 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  52.96 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  51.85 
 
 
274 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  50.74 
 
 
274 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  47.58 
 
 
281 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 
274 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
277 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.89 
 
 
277 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  44.57 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 
260 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 
260 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 
287 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  40.07 
 
 
260 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
258 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
263 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.28 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.44 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.8 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.32 
 
 
371 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.94 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.94 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.91 
 
 
370 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 
371 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.3 
 
 
370 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.81 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  49.49 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.8 
 
 
571 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.77 
 
 
443 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.35 
 
 
321 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
229 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
339 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  32.35 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.04 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.04 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.27 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.27 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.19 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>