More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0254 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
348 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  63.09 
 
 
344 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 
350 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.88 
 
 
390 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 
364 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
306 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
360 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
362 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 
389 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.18 
 
 
296 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.22 
 
 
330 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 
304 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 
366 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
421 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
400 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
364 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 
352 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 
349 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
318 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  37.01 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
318 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
318 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  35.18 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
347 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
353 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
297 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.08 
 
 
299 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
273 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
299 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.82 
 
 
320 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
266 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
352 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 
273 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29 
 
 
266 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.83 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  28.52 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.57 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.62 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.29 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.96 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
462 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
273 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.15 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  27.95 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.68 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.52 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  25.85 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.44 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>