More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1356 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  91.67 
 
 		 277 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  80 
 
 		 281 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  62.59 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  61.85 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  61.11 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  60.95 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  60.95 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  53.53 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  53.9 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  51.48 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  50.19 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  50.75 
 
 		 260 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  50.54 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  48.72 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  48.88 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  48.89 
 
 		 269 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.02 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.04 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.04 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.86 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.21 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.3 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  37.17 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.42 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.44 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.9 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  38.52 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.31 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.09 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  20.62 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  41.49 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  37.11 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.91 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.91 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>