More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1835 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
268 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  69.55 
 
 
270 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  66.67 
 
 
268 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  67.04 
 
 
272 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 
273 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  60.37 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  58.52 
 
 
269 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  55.6 
 
 
279 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  58.52 
 
 
269 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 
277 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  51.11 
 
 
281 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  51.49 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  50.75 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  49.63 
 
 
271 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  50.37 
 
 
274 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  51.87 
 
 
274 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  51.48 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
260 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  43.18 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 
287 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  40.38 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
260 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
263 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
256 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
258 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
571 aa  86.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.04 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.04 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.68 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.68 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  29.02 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.18 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  34.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  33.81 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.69 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.69 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.69 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.52 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.39 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
350 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.86 
 
 
370 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  33.87 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>