More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2759 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  74.44 
 
 
268 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  74.17 
 
 
273 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  74.17 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  70.85 
 
 
269 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  69.42 
 
 
279 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  72.06 
 
 
269 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  67.65 
 
 
270 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  67.04 
 
 
268 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  54.07 
 
 
274 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  55.02 
 
 
277 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  51.84 
 
 
281 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  53.7 
 
 
274 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  51.85 
 
 
274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 
274 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 
271 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  53.53 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
260 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 
260 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 
260 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  47.16 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  41.79 
 
 
260 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.14 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.39 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.86 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.86 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.86 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.67 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  25.1 
 
 
571 aa  65.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.7 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.99 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.09 
 
 
443 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.78 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.89 
 
 
370 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.84 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.17 
 
 
371 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.54 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.54 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.39 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.4 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.63 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.69 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  29.2 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
339 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.91 
 
 
370 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  29.91 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>