More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3159 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
268 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  74.44 
 
 
272 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  68.05 
 
 
270 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  69.63 
 
 
273 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  69.63 
 
 
273 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 
268 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  68.15 
 
 
269 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  65.34 
 
 
279 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
269 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  54.1 
 
 
274 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  52.61 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 
271 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  51.87 
 
 
274 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  52.42 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  51.12 
 
 
274 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 
281 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 
277 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  44.7 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 
260 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  43.02 
 
 
260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
260 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  41.44 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
258 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
263 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
255 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.34 
 
 
571 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.91 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.91 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.86 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.79 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.91 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.84 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.32 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.98 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.51 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.95 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.31 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.31 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.31 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  38.28 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.88 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  29 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
352 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  39.25 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>